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密码子使用模式的评估在固氮无教养的海洋藻青菌Ucyn-A

作者(年代):Ratna Prabha, Dhananjaya p·辛格和阿伦k·沙玛

据报道,近年来,某些蓝藻缺乏功能性PS光合作用的二世。这些单细胞固氮蓝藻称为UCYN-A还不是在实验室培养,海洋生态系统的氮输入的主要因素。这样一个藻青菌的基因组序列是可用的,密码子的选择使用各种in-silico模式分析和统计技术。发现,T和/或一个终止密码子是主要的。观察成分突变偏差的主要因素之一,负责基因密码子的偏见。有效数量的密码子之间有很强的正相关关系(Nc)和GC3S含量也观察到显示密码子的使用是受基因核苷酸组成。平移选择和基因长度被观察到的一个小角色在影响密码子使用的基因变异。多元统计分析发现,没有任何主要说明轴在这个有机体。一组16密码子被确定为最优密码子的使用χ2检验(P < 0.01)。因此,以上分析表明,复合的约束在选择中扮演主要的角色在UCYN-A基因组密码子也是影响转化的选择,虽然在低量。