文摘

过渡态的熵核糖体的肽键的形成

作者(年代):卢马萨#起来Gindulyte,杰罗姆·卡乐

在前面的纸,用量子力学我们调查了肽键形成的机制。的计算是基于选择50个原子被认为是重要的机制。我们使用密度泛函理论来优化几何和能源过渡态(TS)的肽键的形成。计算提供激活能源和TS的反应机制,但没有考虑其热力学参数。在本文中,我们计算熵iA„SAA‡,焓iA一„HAA‡,和自由能源iA„棉酚对TS‡反应。使用过渡态理论(TST)计算基于TS反应的速率常数计算iA„棉酚‡。当rRNA肽基转移中心(PTC)被认为是与反应物通过它我们发现焓和熵为TS的催化反应。