摘要

钠离子在环肽纳米管中转运的分子动力学研究

作者(年代):杰程

为了探索Na+在环八肽纳米管中的约束，以{cyclo[(- d - ala - l - ala)4-]}10为模型，利用转向分子动力学(SMD)研究了环肽纳米管介导Na+跨膜转运的机制。结果表明，Na+的迁移方式为跃迁，跃迁距离为相邻环间的距离。整个过程中Na+的迁移速度为0.00637 Å /ps。环面瞬时速度接近于零，环间瞬时速度为3.3-3.5 Å/ps。Na+在环面上倾向于停留在纳米管的中轴线上，在纳米管的静电作用下向环面上的壁面靠近。