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映射的基因组

乔治。布朗^*

*通信:

乔治。布朗
阿伯丁大学Slovania
电子邮件: (电子邮件保护)

文摘

基因组学是整个基因组的研究,包括整个的一组基因,他们的核苷酸序列和组织,以及他们内部和物种之间的相互作用。技术决定基因的位置染色体被称为基因组映射。地图由基因映射类似于我们使用的地图导航城市街道。遗传图谱是一个图,显示了染色体上基因的位置。基因地图使用遗传标记创建一个大图(类似于一个州际高速公路地图)(类似于地标)。

介绍

基因或遗传标记染色体序列co-segregates(显示基因连接)和一定的特质。这被称为连锁分析早期遗传学家。(如一个详细的路线图)物理地图显示的较小部分染色体的精确的细节。一个物理地图描绘了核苷酸基因或之间的距离遗传标记在核苷酸。生成一个基因组的完整图像,遗传连锁图和物理地图都是必需的。研究人员现在可以研究单个基因简单,他们有一个全面的基因组地图。人类基因组地图援助人员在追求人类致病基因,例如那些与癌症、心脏病和囊性纤维化。基因组映射也可以用于其他方面,如采用活微生物清理污染,甚至避免污染。植物基因组映射研究可能导致改善作物产量或植物的发展更适应气候改变。

基因地图

连锁分析,这一过程评估基因的重组频率是否独立分配或显示有关,是第一步在遗传研究地图。之前发现的DNA,所使用的术语“链接”。要理解生物体的基因型,早期遗传学家依靠表型变化的观察。后不久孟德尔(现代遗传学之父)提出,特征是由什么是现在被称为基因,其他研究人员注意到,不同的特征经常被继承在一起,得出的结论是,身体都有关,因为他们的基因在同一染色体。第一个基因地图的发展是基于基因相对于彼此的映射用连锁分析。从研究的后代之间交叉的父母不同的特质,他们发现某些特征总是当别人并不相关。例如,研究人员观察到花的颜色和形状的植物的花粉在豌豆连接特性,这附近的基因编码这些特征在相同的染色体。基因重组DNA同源DNA链之间的交叉,如nonsister染色单体交换DNA同源染色体之间的染色体。连锁分析是研究两个基因间的重组的频率。两个基因之间的距离越大,越有可能重组事件会发生,以及重组的频率。 Researcher depicts two options for recombination between two nonsister chromatids during meiosis. A pair of genes is said to be related if their recombination frequency is less than 50%.Restriction fragment length多态性(rflp),可变串联重复序列数(VNTRs),微卫星多态性和单核苷酸多态性是一些遗传标记用于创建基因地图(snp)。当一个个体的DNA是使用限制性内切核酸酶切识别特定序列DNA形成一连串的DNA片段,然后研究了凝胶电泳,rflp(有时明显“rif-lips”)。用特定的限制性内切酶时,每个人的DNA产生一个独特的乐队的模式,这是经常被称为DNA“指纹”。The development of the unique banding pattern is caused by polymorphism in certain areas of the chromosome. VNTRs are repeated sets of nucleotides present in the non-coding regions of DNA. Non-coding, or “junk,” DNA has no known biological function; however, research shows that much of this DNA is actually transcribed. While its function is uncertain, it is certainly active, and it may be involved in the regulation of coding genes. The number of repeats may vary in individual organisms of a population. Microsatellite多态性VNTRs是相似的,但重复单元非常小。单核苷酸多态性是一个单核苷酸的变化。因为基因地图完全依赖自然的复合过程,自然增加或减少的程度在任何特定的种族竞争地区复合的基因组影响映射。的某些部分基因组重组热点,而其他展览重组倾向。因此,它是至关重要的检查映射来自各种数据源的数据。

物理地图

遗传标记之间的物理距离,以及核苷酸的详细物理图谱。可以创建物理地图使用三种方法:细胞遗传学映射,辐射混合映射,映射序列。辐射的用量,形成小的或大的碎片可以改变。该方法消除了基因映射的局限性,通过重组频率变化的影响。序列映射是通过DNA测序技术,使全面建设物理地图碱基对的距离测量。物理映射已经加速了基因组库的建设和互补DNA(互补)库(克隆或全部基因组的DNA序列的集合)。信息收到从微观检查染色体部分用于染色细胞遗传学映射(图2),估计距离遗传标记可以由细胞生成的映射,但不能准确的距离(碱基对数量)。使用x射线辐射混合映射DNA断裂成碎片或其他形式的辐射。

集成的遗传和物理地图

大纲是由基因地图,而物理地图提供的细节。很容易看出为什么两种类型的基因映射方法对于显示总体情况是必要的。检查基因组,收到的信息从每个技术相结合。不同的模型物种是用于研究,基因映射就是其中之一。基因组映射仍然是一个进展中的工作,更多的进步预计开发更先进的技术[5]。基因组映射是喜欢一起把一个复杂的谜题使用每一个可访问的信息。来自世界各地的实验室信息映射和进入中央数据库就像国家中心的基因库生物技术信息(NCBI)。